I、边陲监狱（2147纪前）
大孔洞
匹诺康尼位于阿斯德纳星系，一片「忆质」充盈的星系。数千年前，当地爆发了忆域泄露，形成了「大孔洞」。罪魁祸首很可能是到处在忆域边界凿泄口的「神秘」迷思。
边陲监狱
当时，和流光忆庭合作的星际和平公司将匹诺康尼建设成边陲监狱，在监察麦考伊•德纳尔的铁腕统治下，流放至此的犯人被要求进行强制劳动，在缺乏防护设施的情况下暴露于汹涌流溢的忆潮中，以此修补忆质在现实星系中的泄口。当时的犯人鱼龙混杂，既有罪有应得的，也有含冤入狱的。但在频繁暴露于忆质的劳作中，这些犯人都意识到自己渐渐踏入一处奇妙的联觉梦境，在其中他们寻得一个共同的梦想——「自由」。
监狱中的生活
尽管监狱的生活酸涩困苦，但人们仍想在生存之于开心一会。那时犯人的一些生活习惯也对现在有影响。
比如犯人葛瑞迪发明了原始的梦泡拍摄技术，并利用监察德纳尔的贪财成立了葛瑞迪公司，日后暗中为独立战争提供了部分启动资金。监狱时代遗留下来的镍币影院和资产也成为了后来人们重建电影产业的基础。
当时监狱押送犯人的囚笼车后来也发展为匹诺康尼知名体育项目——球笼车竞技。
II、独立战争（2147纪——2149纪）
总览
琥珀2147纪初，万界之癌全面爆发，星核阻断了星轨。乘此千载难逢之机，犯人们在哈努努的带领下揭竿而起，公司称其为「边陲战争」，而阿斯德纳人称其为「独立战争」。得道多助失道寡助，战争过程中，囚犯们得到了悲悼伶人、假面愚者、星穹列车、恶兆先锋等一众派系的帮助，最终于2149纪打跑公司，成了这片新生国度的主人。
要理清独立战争，我们得先了解几个人物。
哈努努
首先是首义之人，匹诺康尼的陈胜吴广——哈努努。他是来自纳肖巴的哈贝克狼人，曾于2147纪一手策办了蒙托尔星系的大动乱，被公司判了终身监禁，押往匹诺康尼。从日后哈努努和米哈伊尔的交往来看，哈努努同样是个很有抱负的理想主义者，这次动乱相比另有隐情。尤其在蒙托尔星系还是家族的重地，歌斐木故乡的情况下。
哈努努是那种安分不了的人，尤其是监狱统治实在是太黑暗了。“哪里有压迫哪里就有反抗”，在他的带领下，囚犯们开始走私物资、建立组织，一度控制了大部分地区，但一颗星核的降临带来了混乱的联觉梦境，导致哈努努和他的战友们走散了。关于早期起义的记载在活动《哈努兄弟越狱记》中。
星穹列车
与此同时，我们把视角望向星穹列车罗盘号。前代领航员法尔肯·阿蒙森帽子师傅为阻止反物质军团炸弹头的暴行，早早地结束了自己的旅程。但旅途还得继续，在新任领航员格兰霍姆安乐椅男孩的带领下，米哈伊尔钟表小子又经历了在卓瑞娜-乌尔德星系镜子王国、弗拉提边陲小镇的冒险，结识了新伙伴拉扎莉娜镜子公主、铁尔南左轮队长。
后来列车欠了一笔债，因此答应公司鳄鱼商人去探索一下发生了暴动的「噩梦小镇」。看来公司是妖魔化了匹诺康尼的情况。为什么公司要雇佣列车不自己上？很明显，万界之癌爆发公司自己要处理一堆乱账，战略投资部就是这时候诞生的，公司此时根本腾不出手处理一个小小的边陲监狱。
还有，列车负债的原因是不是这个“在动物园花光了赚来的积蓄”，该不会是在哈衣艾怡联邦卖了一堆鼻行兽幼崽吧，这事当年阿基维利也干了，这就是无名客的传承吗？
有关苏萨先生和苏乐达的问题
围绕苏乐达的故事，可以称得上一场罗生门。
我们可以确定的是，最初的苏萨水只是苏萨先生在监狱里创造的廉价糖水。后来在逐梦时代，艾迪恩先生收购、改进了他的秘方，才有了现在的苏乐达。
而其余的细节，都是谜团。
首先，苏萨先生为什么来到监狱？传说中元年苏乐达的原料梦见草又是什么？
在苏乐达公司发行的《苏乐达传：瓶中之梦》中，2148纪，苏萨先生是为了传播希佩的福音才来的监狱的。他在当地发现一种特殊的原材料——梦见草。可惜的是，梦见草在现实中灭绝了，现在人们只能到梦境中品尝元年苏乐达。
而在《酒馆夜谭：苏乐达特刊》中，按假面愚者迈尔斯的调查，梦见草从未存在，这只是为了饥饿营销编出来的。而苏萨也不是圣人，而是一个因走私忆质而进监狱的囚犯。不过假面愚者的话有几分可信，就见仁见智了。
不过梦见草的事貌似却有隐情，艾迪恩一直想打压民间销售的苏萨水，出了产权纠纷外，好像还怕他们泄露什么一样：最初的苏萨水根本就不是无比可口的元年苏乐达，只是劣质的糖浆饮品，是当年流着血泪的囚犯少有的廉价快乐罢了。
相遇
大约2148纪，列车抵达匹诺康尼，发现这里和公司描述的不太一样。他们第一个遇上苏萨汽水先生，苏乐达的发明者。然后又遇上了哈努努哈努兄弟，不过这最初的相遇并不愉快，哈努努估计是把列车团当成公司走狗了，直接来了发火箭炮。不过考虑到列车出发的原因这还真没错。在苏萨先生的调停和真·公司走狗鳄鱼的助攻下，双方冰释前嫌，达成合作。
接下来出场了一连串新人物，简单介绍下：
其他人物
马格诺，一个阴险狡诈的政治犯，日后的橡木家系首任家主。
阿斯娜野花姐姐，一位蒙冤入狱的宇宙歌者，日后的鸢尾花家系首任家主。
拉契卡·艾弗法叶子店长，老奥帝的父亲，公司传统项目部的贪污犯，日后的苜蓿草家系首任家主。
图尔度·格拉克斯猫头鹰老师，前博识学会星空生态学派成员，一个让公司蒙受巨额损失的疯人学者，日后的隐夜鸫家系首任家主。
果树姑娘，日后的黑布林家主。
凯勒贝克蝴蝶，日后的灯蛾家主。
爱哭鬼，独立战争时帮忙的悲悼伶人。
面具小丑，独立战争时帮忙的假面愚者。
解放
战争过于惨烈了，有的囚犯投奔公司，有的自立山头。在决战中，由于叛徒的出卖，起义军的假面愚者和悲悼伶人都牺牲了，他们化作了欢欣和悲伤的齿轮，米哈伊尔也产生了愤怒的齿轮。最后，他平静了下来，化作最后一个齿轮。
决战的前夜，哈努努做了个怪梦：他看到了一颗大树茁壮成长，一片荒原建起高楼，一枚钟表埋在地下……最后是一首平静的事。
战火平息。付出了很多牺牲后，噩梦小镇变作了美梦小镇。
事后，米哈伊尔想了很多，决定同拉扎莉娜和铁尔南一起留下来建设匹诺康尼，格兰霍姆理解他们的想法，还把阿蒙森先生的帽子留给了他最后的学生——米哈伊尔。两方人马就此分离，米哈伊尔估计没想到，这一别就将是诀别。
此时是2148纪，列车的下一站二相乐园正处于烬土纪元，他们将同当地人一起抵御界外天魔主——归寂的入侵，最终全军覆没……
